Bilim: Otizmle ilişkili sinir hücresi tiplerini ortaya çıkarır

Yeni bir çalışmada, Kaliforniya Üniversitesi, San Francisco (ABD, San Francisco, California, ABD) gibi araştırma kurumlarından araştırmacılar, 100, otizm spektrum bozukluğu (ASD) olan kişilerden 000 ölüm ve ASD olmayan insanlar. Arka beyin hücrelerinin nükleer beyin dizilimi, bu hastalıkta anormal şekilde düzenlenen gen tiplerini ve bu anormal düzenlemeye tabi tutulan hücre tiplerini ortaya çıkarmıştır. Bu sonuçlar gelecekteki ASD araştırmalarının odağını en olası moleküler ve hücresel anormalliklere daraltmaya yardımcı olur. İlgili araştırma sonuçları 17, 2019 Mayıs'ta Bilim dergisinde yayınlandı ve makalenin başlığı 0010010 "idi; Tek hücreli genomikler, hücre tipine özgü moleküler değişiklikleri otizm 0010010 quot ;.

Bilimden Görüntü, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.

0010010 quot; En son teknolojiyi kullanır, tek hücre düzeyinde araştırma yapar, önceki gözlemleri doğrular ve genişletir, 0010010 quot; Los Angeles, Kaliforniya Üniversitesi'nde otizm araştırmacısı olan Daniel Geschwind (yeni çalışmaya dahil değil) dedi. Önceki araştırmalar bizi daha önce hiç ulaşamadığımız bir çözüme götürdü. 0010010 quot;

San Francisco, Kaliforniya Üniversitesi'nden bir genetikçi Stephan Sanders (yeni çalışmaya dahil değil), 0010010 quot; Bu yapılması gereken bir deneydir. Örgütsel düzeyde, otizmle ilgili önceki araştırma verilerini geniş ölçüde yeniden üretir. . Daha sonra ilk kez hangi hücre tiplerinin bu farklılıkları yaptığını inceledi. 0010010 quot;

Şu anda, Amerika Birleşik Devletleri'ndeki çocuklarda ASD insidansı 60 'da yaklaşık 1 civarındadır. Bu hastalık, iletişim ve sosyal becerilerin bozulması ile karakterize edilen çok çeşitli koşulları kapsar. ASD'nin heterojenliği moleküler patoloji araştırmalarını zorlaştırmaktadır. İlk yazar, Kaliforniya Üniversitesi, San Francisco nöroloğu Arnold Kriegstein 0010010 # 39; laboratuvarında doktora sonrası araştırmacı olan Dmitry Velmeshev, ASD'li hastalardan ölüm sonrası beyin dokusunda gen ekspresyonu çalışmalarının Sinaptik fonksiyon da dahil olmak üzere yaygın olarak etkilenen yollar tespit edilmiştir.

Sanders, önceki çalışmaların ayrıca ASD'de azalmış nöronal gen ekspresyonu ve artmış glial hücre gen ekspresyonu için bir eğilim önerdiğine dikkat çekti. Bununla birlikte, 0010010 quot; Bu değişikliklerin hücrenin bu bölümündeki farklılıkları (örneğin, nispeten az sayıda nöron) veya hücrede meydana gelen genetik anormallikleri gösterip göstermediği açık değildir. 0010010 quot;

Velmeshev, bunun 0010010 quot; çünkü insanların yaptığı çok fazla gen ekspresyon araştırması olduğunu, yani spesifik hücre tiplerini incelemek için doğrudan bir yol olmadığı anlamına geldiğini açıkladı. 0010010 quot; Günümüzde, tek çekirdekli RNA dizilemesi adı verilen yeni geliştirilmiş bir dizileme teknolojisi kullanan Velmeshev ve meslektaşları, 15 ASD hastalarının ve 16 serebral korteksinden 000'den fazla tek hücreli çekirdeği test etti. 50 'den fazla gen ekspresyonunu, 0010010 # 39 süjesinde 000 çekirdek; beynini kontrol eder.

Ayrı ayrı çekirdeklerin damlacıklara, barkod etiketlemesine ve RNA'nın sekanslanmasına otomatik olarak ayrılmasından sonra, elde edilen veriler barkodlarına göre ayrı ayrı hücrelere otomatik olarak atanır ve hücre tiplerinin anahtar işaretleyici genlerinin ekspresyonuna göre belirlenmesine izin verir. Bu şekilde Velmeshev 0010010 # 39; ekibi ASD hastaları ve kontrol denekleri arasında önemli ölçüde farklı gen ekspresyonu olan hücre tiplerini tespit edebildi.

ASD'li hastalardan alınan örneklerde, üst korteksteki nöronların en fazla gen anormalliklerini gösterme eğiliminde olduğunu ve sinaptik fonksiyon ve transkripsiyonda yer alan genlerin en fazla etkilendiğini bulmuşlardır. Beyin bağışıklığında rol oynayan mikroglia ayrıca ASD'li hastalarda önemli genetik anormallikler gösterir ve mikroglial aktivasyon genleri ve gelişimsel transkripsiyon faktör genleri en çok etkilenir.

Stanford Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde (bu yeni araştırmaya dahil olmayan) bir ASD araştırmacısı olan Dennis Wall, 0010010 quot; Bu heyecan verici bir gelişme ve çok makul ve önemli bir çalışma gibi görünüyor ... çok ayrıntılı ve zarif bir şekilde Yaklaşım etkilenen yolları tanımlar. Daha fazla araştırmanın beklendiği bir alanın vurgulanmasına yardımcı olur. 0010010 quot;

ABD'deki Sina Dağı'ndaki Icahn Tıp Fakültesi'nden Joseph Buxbaum, 0010010 quot; bunun zarif bir çalışma 0010010 quot olduğuna inanmasına rağmen, örneklem büyüklüğünden endişe duyuyor. Evet, 50, 000 çekirdekten fazla olabilir, ancak sadece 15 hastadan geldi. Bunun 0010010 quot olmadığını, bu yazarların hatası 0010010 quot; ancak 0010010 quot; bu alandaki büyük bir sorunu - çok sınırlı beyin örneklerinin 0010010 quot temel sorununu yansıtmaktadır.

0010010 quot; Bu makaledeki her şeyin doğru olduğuna tamamen inanıyorum, ancak evrensel olmayabilir. 0010010 quot;

Velmeshev, 0010010 quot; diyerek, daha büyük bir veri kümesinde çoğaltmanın kesinlikle önemli olduğunu kabul ediyor. 0010010 quot; 0010010 quot; örneklerimizden daha önce oluşturulmuş verilerle büyük miktarda gen ekspresyon verilerini karşılaştırdığımızda ... Veri kümeleri arasında ASD ile ilgili çok sayıda yaygın transkripsiyonel değişiklik var, 0010010 quot Dedi Kriegstein ve 0010010 quot; çok cesaret verici. 0010010 quot; (bioon.com adresinden hsppharma.com'u derleyin)

Referans:

Dmitry Velmeshev ve diğerleri 0010010 nbsp;Tek hücreli genomik, otizmde hücre tipine özgü moleküler değişiklikleri tanımlar. Bilim, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.